La facturation électronique obligatoire se déploie en vague sur tout le continent. Systèmes actifs : FNE en Côte d'Ivoire (DGI CI), MeCEF au Bénin (DGI Bénin), eTIMS (Electronic Tax Invoice Management System) au Kenya via la KRA, Smart Invoice en Zambie via la ZRA, e-Invoice au Nigeria via la FIRS (obligatoire pour les grandes entreprises depuis 2023). Le principe est commun : la facture est transmise en temps réel à l'administration fiscale qui la signe cryptographiquement ; seule une facture certifiée est opposable à un tiers et déductible. Pour les PME, l'enjeu est de connecter leur logiciel achats au système de l'administration pour automatiser la certification.
Cela dépend du pays et du seuil de chiffre d'affaires. Au Kenya (eTIMS) et au Nigeria, l'obligation couvre déjà toutes les entreprises assujetties à la TVA. En Côte d'Ivoire (FNE) et au Bénin (MeCEF), des phases progressives s'appliquent. Vérifier le seuil auprès de la DGI locale.
Dans les pays où la facturation électronique certifiée est obligatoire, un PDF non certifié n'est pas valable fiscalement même s'il est reçu par email. La certification par le système de l'administration (eTIMS, FNE, MeCEF…) est requise pour que la facture soit déductible.